Pontivy est une gare dédiée exclusivement au fret ferrovaire. Elle est desservie par de lourds trains de marchandises destinés à deux entreprises de la région restées fidèles au rail : Les Établissements GLON et SOFRAL, installés à Saint-Gérand, le long de la ligne de chemin de fer en direction de Loudéac.
Par le tonnage transporté (300.000 tonnes/an), Pontivy est la 2ème gare de Fret de Bretagne. La ligne Auray – Pontivy – Saint-Gérand est entretenue par S.N.C.F Réseau.
